生态学科群目前有5个各具特色的研究方向 ，包括 ：西南植被格局与生物多样性保护 、西南山地物种分化与形成机制 、早期生物演化与环境/生态适应 、高原山地污染 、退化及生态修复和西南高原山地跨境生态安全 。目前拥有国家级 ，教育部以及省级重点实验室 、工程中心多个 ，2020年生态环境学院又新添一个省级重点实验室 。
近5年 ，学科群科研成果丰硕 ，学科群获得国家自然科学基金资助100余项 ，国家级重点攻关项目10余项 ，各层次人才项目多项 。2020年张喜光和侯先光老师获国家自然科学二等奖1项 ，各科研团队获得省 、部级奖励多达十几项 。高水平论文逐年增长 ，发表SCI论文数百篇 ，其中不乏高水文章 ，陈明勇教授课题组在《Science》上发表文章 ，揭示了大坝建设对亚洲象种群的隔离效应 。优发国际(中国)与环境学院赵大克副教授与美国德克萨斯大学Russel J. Reiter教授合作 ，在国际植物学领域顶级学术期刊Trends in Plant Science发表了题为“Phytomelatonin: an emerging regulator of plant biotic stress resistance”的文章(论文链接) 。该论文系统总结了褪黑素增强植物生物逆境胁迫抗性的功能 、分子机制及演化路径 ，并提出了褪黑素在今后农业生产中的应用潜力 。
